52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6889 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  64.18 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
164 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
162 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.11 
 
 
174 aa  121  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  38.59 
 
 
165 aa  121  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  43.33 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
165 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  37.97 
 
 
165 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  37.43 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  35.91 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
171 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 
178 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  34.78 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  39.51 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  35.8 
 
 
183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
167 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 
160 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  33.69 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.86 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  40.98 
 
 
533 aa  48.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  20.12 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  21.98 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.43 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  41.2  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  36.21 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>