17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5836 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  47.32 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  68.42 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  58.33 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  46.51 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  56.72 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  57.89 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  46.99 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  56.14 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  58.93 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  56.14 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  46.34 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  48.39 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  55.17 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  30.83 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  43.28 
 
 		 212 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  39.44 
 
 		 1051 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>