64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5125 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 255 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.64 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.08 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.92 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.2 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.38 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4986  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207268  normal  0.0734509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.49 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  32.88 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.88 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.99 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.88 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.97 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.45 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  34.82 
 
 		 177 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 		 191 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37 
 
 		 163 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.25 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.37 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.81 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.98 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.43 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.91 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.48 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.13 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.8 
 
 		 205 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.17 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.82 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.88 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.28 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.58 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.1 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.69 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.63 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.15 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.12 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.24 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.12 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.52 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.24 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.03 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.2 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.92 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  31.41 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.15 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.92 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.81 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.78 
 
 		 188 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.01 
 
 		 165 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 		 223 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>