80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3321 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  80.2 
 
 		 116 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  49.04 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  40 
 
 		 618 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  44.78 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.78 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  33.94 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  37.25 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  37.25 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  37.25 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  37.25 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  32.43 
 
 		 683 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  40.32 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  39.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  39.34 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.71 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  38.71 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  39.13 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.56 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 		 353 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  37.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  37.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.32 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  25.56 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  39.06 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.32 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.18 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.18 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.82 
 
 		 900 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.51 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  35.94 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  36.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  36.26 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 		 586 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  40.82 
 
 		 353 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  26.74 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.51 
 
 		 354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.1 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  35.05 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  26.74 
 
 		 160 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.51 
 
 		 354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  37.5 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.76 
 
 		 376 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.1 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  37.7 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  38.71 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  33.94 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.44 
 
 		 351 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.29 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.84 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.28 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.74 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.84 
 
 		 113 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.84 
 
 		 113 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.84 
 
 		 113 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>