66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  100 
 
 
318 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  60.07 
 
 
285 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  59.02 
 
 
273 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  59.07 
 
 
278 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  59.5 
 
 
279 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  53.7 
 
 
280 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  57.46 
 
 
272 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  56.67 
 
 
680 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  53.57 
 
 
290 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  58.17 
 
 
276 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  54.31 
 
 
269 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  54.85 
 
 
275 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  55.43 
 
 
271 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  56.93 
 
 
281 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  55.43 
 
 
302 aa  286  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  55.94 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  54.71 
 
 
278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  55.72 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  55.17 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  54.07 
 
 
271 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  53.9 
 
 
272 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  53.9 
 
 
272 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  53.9 
 
 
272 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  52.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  52.08 
 
 
269 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  52.54 
 
 
302 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  51.88 
 
 
277 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  52.14 
 
 
356 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  43.13 
 
 
268 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.92 
 
 
705 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.92 
 
 
705 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.33 
 
 
704 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.97 
 
 
705 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  37.26 
 
 
703 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  37.26 
 
 
703 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  41.7 
 
 
296 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  36.84 
 
 
703 aa  159  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  34.69 
 
 
275 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  34.69 
 
 
275 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  35.74 
 
 
294 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  36.03 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  35.66 
 
 
296 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  20.45 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  26.55 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  24.55 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  29.15 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  29.3 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  24.44 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  23.2 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  30.48 
 
 
418 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  26.37 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  27.48 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  29.22 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  24.69 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  26.34 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  26.34 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  42.86 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  26.34 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  26.34 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  26.34 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  26.34 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  26.34 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  28.65 
 
 
416 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  29.94 
 
 
405 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  30.6 
 
 
417 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>