67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  83.92 
 
 		 144 aa  257  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  46.9 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  47.92 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  45.14 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  46.53 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  44.06 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  41.38 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  41.78 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  40.69 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  39.31 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  34.69 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.11 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  31.69 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  32.54 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  26.81 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  26.81 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  26.81 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  23.4 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  30.47 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 148 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  26.73 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  23.45 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>