12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2083 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  33.83 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  33.06 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  29.53 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  29.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  26.95 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  26.95 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  29.08 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>