29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1173 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6950  glucans biosynthesis protein  57.89 
 
 		 478 aa  352  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.91383  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  30.63 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  28.79 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  25.25 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  25.25 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  25.25 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  25 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  27.71 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  27.47 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  27.03 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  27.47 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  26.4 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  26.18 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  26.96 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  22.7 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  24.92 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.43 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  25.17 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  31.33 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  24.48 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.12 
 
 		 550 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>