15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1015 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 351 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  67.69 
 
 		 218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  36.83 
 
 		 470 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  36.52 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  34.66 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  33.67 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  34.51 
 
 		 439 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  32.38 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  28.79 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  30.97 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  28.09 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  37.4 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  27.78 
 
 		 556 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  33.53 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>