83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1087 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  60.77 
 
 		 135 aa  170  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0194  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0196  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  33.81 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  28.24 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 249 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  31.67 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  28.46 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  30.83 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  27.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  28.24 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  28.06 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  28.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  31.4 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  27.83 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  27.83 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  30.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  30.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 492 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  30.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.01 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  25.22 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1022  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.126342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  25.98 
 
 		 777 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  25.2 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  29.36 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0193  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  0.807046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0417  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456804  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0408  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  23.85 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  27.2 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 		 146 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 		 139 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  22.52 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.06 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  31.76 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  26.42 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>