79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0194 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0194  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0196  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  89.63 
 
 		 136 aa  249  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  30 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  30.25 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  26.89 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  31.3 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  25 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  25 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  28.85 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  26.15 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  28.93 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  28.85 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  26 
 
 		 885 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  28.43 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  29.81 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  25.47 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4052  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  26.67 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  26.81 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 563 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 321 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.46 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  28.45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  24.07 
 
 		 777 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.9 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1839  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.481374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.64 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3706  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0345536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  24.06 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1990  sensor histidine kinase  25.81 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415496  normal  0.485112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 137 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1118  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 792 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  23.31 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 138 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>