24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4466 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  304  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  51.54 
 
 
149 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  59.65 
 
 
144 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  54.62 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  36.17 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  34.43 
 
 
321 aa  73.6  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  30.3 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  30.94 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  30.43 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  32.99 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  29.73 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  28.97 
 
 
350 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  31.46 
 
 
339 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  27.33 
 
 
270 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  34.12 
 
 
421 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.21 
 
 
606 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2290  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 
186 aa  42  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.348422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  24.53 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  22.95 
 
 
188 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  25.69 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  28.04 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  27.17 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>