70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0393 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
560 aa  1174    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1092  oxidoreductase molybdopterin binding  50.77 
 
 
599 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000472494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1013  oxidoreductase molybdopterin binding  46.23 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14191  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  46.57 
 
 
539 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  37.76 
 
 
535 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  32.39 
 
 
529 aa  233  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  30.34 
 
 
552 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  26.44 
 
 
521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.334834  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  26.73 
 
 
359 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  28.38 
 
 
357 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  25.99 
 
 
360 aa  97.8  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  28.39 
 
 
343 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0300  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.33 
 
 
92 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  26.09 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  24.13 
 
 
426 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.36 
 
 
501 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.72 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0299  oxidoreductase molybdopterin binding  28.89 
 
 
270 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  25.85 
 
 
412 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16770  hypothetical protein  31.82 
 
 
92 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.711837  normal  0.749784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  23.64 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  24.44 
 
 
370 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  26.4 
 
 
361 aa  57  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  24.91 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  23.53 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
354 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.55 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  25 
 
 
434 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.22 
 
 
505 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  22.12 
 
 
414 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  25.64 
 
 
512 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.38 
 
 
465 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.64 
 
 
512 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.64 
 
 
512 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  22.67 
 
 
369 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  23.08 
 
 
369 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  26.62 
 
 
528 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16780  sulfite oxidase-like oxidoreductase  27.78 
 
 
268 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.610919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  26.11 
 
 
407 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  21.91 
 
 
408 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.32 
 
 
512 aa  50.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  26.32 
 
 
542 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  26.01 
 
 
423 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  26.07 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  25.41 
 
 
272 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.372289  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  24.12 
 
 
446 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  25.73 
 
 
420 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.14 
 
 
416 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  22.12 
 
 
417 aa  47.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.62 
 
 
552 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  25 
 
 
359 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  22.03 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  22.26 
 
 
406 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  22.32 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  22.64 
 
 
554 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  26.29 
 
 
425 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  23.37 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  24.35 
 
 
417 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  22.49 
 
 
408 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  34.91 
 
 
650 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  22.92 
 
 
410 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.27 
 
 
430 aa  44.3  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.19 
 
 
532 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  35.37 
 
 
650 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  35.37 
 
 
650 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 
538 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  35.37 
 
 
650 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.66 
 
 
508 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  23.27 
 
 
437 aa  43.5  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>