35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2713 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  99.53 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  99.05 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  98.95 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  86.26 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  70.53 
 
 		 212 aa  284  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  69.57 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  68.57 
 
 		 218 aa  274  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  66.5 
 
 		 231 aa  255  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  66.5 
 
 		 231 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  66.5 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  59.9 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  31.41 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  32.11 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  27.96 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.25 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.4 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.66 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  28.57 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.27 
 
 		 219 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>