35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2845 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  99.53 
 
 
211 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  99.05 
 
 
211 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  86.73 
 
 
211 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  70.53 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  69.57 
 
 
212 aa  275  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  68.57 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  66.5 
 
 
231 aa  255  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  66.5 
 
 
231 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  66.5 
 
 
215 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  60.4 
 
 
224 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  31.41 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  32.11 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  27.96 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  29.95 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.8 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.4 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  25.81 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.66 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.79 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.79 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  26 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  26 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  28.57 
 
 
289 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>