18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3653 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.81 
 
 		 2104 aa  893    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  42.32 
 
 		 1422 aa  330  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  33.73 
 
 		 2106 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 2120 aa  270  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 		 2104 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  29.71 
 
 		 2104 aa  253  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 2104 aa  250  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.92 
 
 		 685 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  47.78 
 
 		 459 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1722 aa  57.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  46.43 
 
 		 1578 aa  53.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.05 
 
 		 1723 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 		 1607 aa  50.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  43.14 
 
 		 2093 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.22 
 
 		 1589 aa  47.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.38 
 
 		 1542 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 		 1525 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>