More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0768 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  83.22 
 
 		 459 aa  826    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 459 aa  955    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 457 aa  591  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0333  cysteinyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 507 aa  420  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.663896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.65 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 460 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 460 aa  392  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 454 aa  385  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>