27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0164 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  97.47 
 
 
79 bp  141  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0204711  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  100 
 
 
100 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 
98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>