64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0021 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0204711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0053  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531886  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1532  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0027  tRNA-Arg  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  84.13 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0019  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0987359  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0031  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.501356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0033  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0009  tRNA-Arg  83.33 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133621  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0094  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000691551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>