18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2612 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  53.67 
 
 
339 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  53.37 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  40.31 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  40.31 
 
 
294 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  37.08 
 
 
318 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  36.57 
 
 
310 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  32.7 
 
 
369 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  30.75 
 
 
425 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  29.09 
 
 
351 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  27.53 
 
 
376 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  27.76 
 
 
368 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  26.36 
 
 
331 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4202  hypothetical protein  25.37 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  26.36 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  23.97 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>