26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2846 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  929    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  66.67 
 
 
466 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  53.21 
 
 
476 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  52.51 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  53.64 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  52.44 
 
 
447 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  51.15 
 
 
448 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  50.21 
 
 
460 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  41.92 
 
 
510 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  40.35 
 
 
505 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  36.09 
 
 
529 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  40.75 
 
 
542 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  35.36 
 
 
543 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  36.05 
 
 
510 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  33.68 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  33.53 
 
 
476 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  35.39 
 
 
534 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  38.96 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  34.82 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  34.23 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  28.31 
 
 
447 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  26.25 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  32.8 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  22.83 
 
 
462 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  34.94 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>