More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1921 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
434 aa  882    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  69.81 
 
 
396 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.39 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  54.86 
 
 
435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  59.05 
 
 
373 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  51.25 
 
 
360 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  49.72 
 
 
388 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.49 
 
 
383 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.29 
 
 
363 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.45 
 
 
386 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.83 
 
 
360 aa  270  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
352 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 
352 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.7 
 
 
352 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.5 
 
 
368 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 
381 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  36.53 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  38.52 
 
 
400 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 
366 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.83 
 
 
396 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  38.24 
 
 
374 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  35.14 
 
 
371 aa  229  6e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  35.34 
 
 
366 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
355 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 
353 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.29 
 
 
351 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  38.87 
 
 
352 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  36.51 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.17 
 
 
368 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  36.99 
 
 
362 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.46 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  36.63 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  36.63 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  35.42 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.36 
 
 
368 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.4 
 
 
375 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.42 
 
 
361 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
365 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
362 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.78 
 
 
355 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 
370 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  40.15 
 
 
347 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.7 
 
 
355 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.78 
 
 
355 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  34.9 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  34.9 
 
 
365 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 
355 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 
382 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
365 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.36 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  35.01 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  35.1 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  35.36 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.08 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  33.61 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.96 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  34.47 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  33.79 
 
 
354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.92 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  34.44 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  35.29 
 
 
350 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  35.58 
 
 
382 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 
358 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.21 
 
 
384 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
365 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  37.58 
 
 
419 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 
358 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.2 
 
 
393 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  37.27 
 
 
383 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.43 
 
 
367 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  35.44 
 
 
382 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  41.41 
 
 
401 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  38.13 
 
 
363 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.54 
 
 
381 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2013  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 
401 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.05 
 
 
353 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.99 
 
 
355 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  34.25 
 
 
350 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 
355 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  37.25 
 
 
371 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
353 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>