294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0280 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0280  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
123 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.346629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.42 
 
 
124 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.92 
 
 
123 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.16 
 
 
124 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.92 
 
 
127 aa  124  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2044  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.38 
 
 
123 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.4 
 
 
126 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.41 
 
 
126 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.44 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  53.66 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  52.17 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.22 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
130 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.62 
 
 
543 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  41.46 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.75 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  42.74 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.19 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
131 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.54 
 
 
130 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.51 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1943  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.53 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577791  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.9 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  43.9 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.09 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.55 
 
 
119 aa  87  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.63 
 
 
128 aa  87  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.09 
 
 
129 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.09 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.04 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.67 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.4 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
132 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.08 
 
 
131 aa  83.6  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.2 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.67 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.53 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  45.69 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  42.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.41 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.64 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.56 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.19 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  50.4 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.35 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.41 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.15 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.32 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.65 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>