105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0133 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0133  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2191  hypothetical protein  46.58 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  33.64 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 202 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0041  quinone methlytransferase  34.22 
 
 		 168 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000105816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  32.14 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.48 
 
 		 351 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.8 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  30.86 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.17 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  29.19 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.83 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 199 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  25.42 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.13 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1231  hypothetical protein  37.84 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  31.61 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.82 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.17 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.09 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  29.59 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.38 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.4 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.66 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  24.22 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.95 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.24 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  28.12 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  28.39 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.13 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  50 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.01 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  24.69 
 
 		 351 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.54 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.12 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2172  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.07 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4383  methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  26.01 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.68 
 
 		 251 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  34.67 
 
 		 247 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 247 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>