53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2926 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  100 
 
 
237 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  54.63 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  49.57 
 
 
255 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  44.98 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  43.42 
 
 
247 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  49.44 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  42.79 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  36.94 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  40.83 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  36.82 
 
 
243 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  36.82 
 
 
243 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  40.61 
 
 
227 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  35.45 
 
 
233 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  38.05 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  37.73 
 
 
235 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  36.7 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  36.7 
 
 
231 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  41.34 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  40.89 
 
 
230 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  40.89 
 
 
230 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  35.78 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  39.29 
 
 
230 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  36.52 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  43.32 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  37.18 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  37.71 
 
 
234 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  40.89 
 
 
265 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  39.06 
 
 
244 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  43.82 
 
 
220 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  37.39 
 
 
262 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  41.78 
 
 
259 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  41.33 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  41.33 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  41.33 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  41.33 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  41.33 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  35.68 
 
 
225 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  35.68 
 
 
225 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  35.62 
 
 
251 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  41.81 
 
 
223 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  35.29 
 
 
262 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  35.14 
 
 
235 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  34.46 
 
 
235 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  32.77 
 
 
235 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  38.26 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  34.8 
 
 
227 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  39.15 
 
 
228 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  37.66 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  40.78 
 
 
229 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  31.96 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  35.22 
 
 
158 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>