More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2328 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2328  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00827225  normal  0.0170821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.94 
 
 
166 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.96 
 
 
168 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04500  iron-sulfur cluster-binding protein CooF  44.94 
 
 
185 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.64 
 
 
201 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10134  normal  0.880841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.69 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0586369  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3526  carbon-monoxide dehydrogenase, Fe-S subunit  40 
 
 
165 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1426  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.86 
 
 
190 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.49 
 
 
189 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4499  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.37 
 
 
192 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.249413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.13 
 
 
155 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00595725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.27 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1755  Iron-sulfur cluster-binding protein  40.27 
 
 
149 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.176343  normal  0.108296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.51 
 
 
149 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.71 
 
 
158 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1238  iron-sulfur cluster-binding protein  39.6 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2096  iron-sulfur cluster-binding protein  41.03 
 
 
197 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.91 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.957974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.78 
 
 
149 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214822  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.91 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.27641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0059  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1  41.14 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000464902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  35.67 
 
 
201 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0616  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.74 
 
 
197 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  39.13 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  39.13 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  38.51 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  38.51 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2051  nitrate reductase electron transfer subunit  37.09 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1766  nitrate reductase electron transfer subunit  37.09 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.15 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.05 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.75 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0189  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.67 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.26 
 
 
667 aa  94.4  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.09 
 
 
189 aa  94  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.41 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.13 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.519083  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
653 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
653 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
653 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.67 
 
 
151 aa  91.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
659 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.94 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.48 
 
 
653 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.58 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.48 
 
 
653 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.62 
 
 
671 aa  90.5  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.66 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.31 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  36.13 
 
 
639 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  36.13 
 
 
639 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0887  putative oxidoreductase, Fe-S subunit  37.5 
 
 
166 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.423748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
641 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
639 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
639 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.13 
 
 
639 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  35.03 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  35.03 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.91 
 
 
658 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 
143 aa  88.2  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000636353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  35.03 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.03 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1057  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, B subunit  35.43 
 
 
205 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.4 
 
 
173 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.39 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  35.03 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00899  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit B  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2748  dimethylsulfoxide reductase, chain B  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1133  iron-sulfur cluster-binding protein  37.16 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000983522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2701  dimethylsulfoxide reductase, chain B  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2225  dimethylsulfoxide reductase, B subunit  35.43 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.784709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1000  dimethylsulfoxide reductase, B subunit  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0971  dimethylsulfoxide reductase, B subunit  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00906  hypothetical protein  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_951  iron-sulfur cluster domain protein  37.16 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2433  dimethylsulfoxide reductase, B subunit  35.43 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.651857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  35.8 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  35.8 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  32.75 
 
 
180 aa  84  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3155  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 
158 aa  84  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.84 
 
 
644 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  35.19 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.35 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.15 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  35.19 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  31.07 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0289  dimethylsulfoxide reductase, chain B  30.52 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>