More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0199 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.67 
 
 
151 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252517 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.26 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.6 
 
 
152 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.27641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.6 
 
 
151 aa  121  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.957974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1755  Iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 
149 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.176343  normal  0.108296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1238  iron-sulfur cluster-binding protein  42.18 
 
 
149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.16 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00595725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_951  iron-sulfur cluster domain protein  43.57 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1133  iron-sulfur cluster-binding protein  43.57 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000983522  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.57 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.69 
 
 
189 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.31 
 
 
188 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.62 
 
 
659 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.23 
 
 
153 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.1 
 
 
653 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.1 
 
 
653 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.1 
 
 
653 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2096  iron-sulfur cluster-binding protein  35.53 
 
 
197 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.64 
 
 
674 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.1 
 
 
653 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.88 
 
 
674 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1426  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
190 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.39 
 
 
653 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.31 
 
 
658 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  35.33 
 
 
180 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2328  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.41 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00827225  normal  0.0170821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  35.43 
 
 
639 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.43 
 
 
639 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.43 
 
 
639 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  35.43 
 
 
639 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.43 
 
 
639 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.43 
 
 
641 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
166 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  35.17 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.96 
 
 
671 aa  90.5  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.65 
 
 
644 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.5 
 
 
667 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0887  putative oxidoreductase, Fe-S subunit  34.93 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.423748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4499  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32 
 
 
192 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.249413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.95 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2051  nitrate reductase electron transfer subunit  31.03 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1766  nitrate reductase electron transfer subunit  31.03 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0616  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 
197 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.21 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214822  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.77 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.72 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.77 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.77 
 
 
157 aa  84  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0059  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1  32.68 
 
 
198 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000464902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  84  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  35.77 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  35.77 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  31.87 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.9 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.9 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  32.26 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.64 
 
 
671 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.79 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.64 
 
 
671 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.42 
 
 
201 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10134  normal  0.880841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  35.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  35.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.72 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000221809  normal  0.228333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04500  iron-sulfur cluster-binding protein CooF  34.25 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.81 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2316  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  33.07 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.581036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.69 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0289  dimethylsulfoxide reductase, chain B  31.97 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.51 
 
 
652 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  31.65 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2798  aspartate carbamoyltransferase  34.07 
 
 
686 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.604393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>