34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3568 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  966    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  32.2 
 
 		 517 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  33.08 
 
 		 513 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  30.78 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  27.92 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  28.34 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  28.88 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  23.39 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  26.46 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  25.06 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  25.71 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  26.02 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  23.02 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  24.73 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  24.11 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  23.16 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  23.36 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  21.92 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.44 
 
 		 285 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 734 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  23.04 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28.57 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  18.81 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  18.35 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  24.89 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  22.17 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  23.24 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  21.56 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  23.16 
 
 		 271 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  23.48 
 
 		 277 aa  43.5  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>