More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2853 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  80.7 
 
 		 430 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  72.46 
 
 		 431 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  72.22 
 
 		 431 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  80.93 
 
 		 430 aa  749    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  69.01 
 
 		 432 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  75.06 
 
 		 427 aa  656    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  81.54 
 
 		 430 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  80.75 
 
 		 435 aa  734    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  70.53 
 
 		 427 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  71.67 
 
 		 424 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  83.33 
 
 		 426 aa  765    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  901    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  74.64 
 
 		 421 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  82.71 
 
 		 429 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  69.25 
 
 		 432 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  68.78 
 
 		 432 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  71.05 
 
 		 428 aa  627  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  62.38 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  49.36 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  46.34 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  64.15 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  43.85 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  40.45 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  40.23 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  41.39 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  40.37 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  39.34 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  40.61 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  38.83 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  39.07 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  37.59 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  40.82 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  39.65 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  39.54 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  38.1 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  39.07 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  36.1 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  37.17 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  35.9 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  37.43 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.66 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 358 aa  150  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 1823 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 		 338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 		 337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.34 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 1912 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.64 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 		 340 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.97 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 1912 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.64 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.32 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.52 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  27.17 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.5 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.01 
 
 		 329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.74 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.6 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.46 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.46 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.17 
 
 		 322 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  25 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.32 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.22 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 		 342 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.2 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.2 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.2 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  28.62 
 
 		 320 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 		 336 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.53 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.36 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>