48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1715 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  46.86 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  24.91 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  24.86 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  22.68 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  25.66 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  25.66 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  21.33 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  22.75 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  22.75 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  26.18 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  21.74 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  27.47 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  25.68 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  23.26 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  27.14 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  26.39 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  20.82 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  22.18 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  26.03 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  21.97 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  23.81 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  23.21 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  23.14 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  23.18 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  23.18 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  26.25 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  23.73 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  23.1 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  25.28 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  22.12 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  23.24 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  21.93 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  23.08 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  21.71 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  23.93 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  27.63 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  27.63 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  22.44 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  24.14 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  22.41 
 
 		 623 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  24.68 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.75 
 
 		 681 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  25.63 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  23.29 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  31 
 
 		 124 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  21.05 
 
 		 300 aa  42  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>