45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0879 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  48.74 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  49.15 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  45 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  37.1 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  47.62 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  38.94 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  40.86 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  32 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  32 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  32 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  32.33 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  30.89 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  31.78 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  31.78 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  37.37 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  32.52 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  32.82 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  34 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  29.57 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  35.35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  36.36 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  29.69 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  37.36 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  32.79 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  30.6 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  30.6 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  35.16 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>