47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0563 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  100 
 
 		 420 aa  848    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  75.48 
 
 		 420 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  77.67 
 
 		 422 aa  627  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  68.5 
 
 		 441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  68.26 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  68.04 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  60.19 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  58.22 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  60.4 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  60.4 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  59.19 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  58.33 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  55.7 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  51.82 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  49.27 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  50.5 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  49.51 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  53.46 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  50 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  53.68 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  50.77 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  51.28 
 
 		 475 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  52.52 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  54.26 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  54.26 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  54.59 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  52.96 
 
 		 458 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  52.69 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  52.11 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  44.72 
 
 		 486 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  40.6 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  44.79 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  44.79 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  38.24 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  43.73 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  37.37 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  39.27 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  37.25 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  39.52 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  20.39 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  23.63 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  21.5 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.36 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  22.97 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  31.46 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  27.21 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.47 
 
 		 383 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>