17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0292 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  78.64 
 
 		 206 aa  344  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  73.3 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  62.07 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  59.41 
 
 		 199 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  56 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  27.62 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  33.09 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  24.52 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  34.81 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  26.62 
 
 		 467 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  22.96 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 597 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  27.35 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 573 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>