More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2300 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2300  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 389 aa  801    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  73.78 
 
 		 389 aa  586  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2287  S-adenosylmethionine synthetase  71.43 
 
 		 390 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000191933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1496  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 		 391 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000460029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0786  S-adenosylmethionine synthetase  70.33 
 
 		 391 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2941  S-adenosylmethionine synthetase  69.92 
 
 		 389 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 389 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  61.83 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  62.02 
 
 		 387 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 		 384 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  62.04 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  62.27 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  59.74 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  62.73 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  60.52 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0159  S-adenosylmethionine synthetase  63.95 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  64.91 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  60.52 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.74 
 
 		 390 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  62.04 
 
 		 389 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.05 
 
 		 383 aa  494  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.05 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.58 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  60.26 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  58.84 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  59.42 
 
 		 381 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  61.26 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  61.26 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  58.9 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  58.66 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  62.86 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04686  S-adenosylmethionine synthetase  58.47 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  62.86 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  60.1 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  62.6 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  58.96 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  59.59 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  59.16 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  56.97 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  61.24 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  59.74 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  57.91 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  59.32 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  56.47 
 
 		 403 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  59.21 
 
 		 382 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>