21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1163 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  30.83 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  26.89 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  26.69 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  27.15 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  43.37 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  34.01 
 
 		 590 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  34.01 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  28.96 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  23.93 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  26.42 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  40 
 
 		 612 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  29.75 
 
 		 589 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  38.16 
 
 		 434 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  27.18 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>