66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2017 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  48.22 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  28.97 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 380 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  30.42 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  29.66 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  29.84 
 
 		 310 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  26.54 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  27.52 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  27.06 
 
 		 342 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  31.63 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  27.38 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  31.38 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  25.58 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  29.32 
 
 		 307 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  23.48 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  21.62 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  23.05 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  21.08 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  22.1 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  21.94 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  23.44 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  22.92 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  26.21 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  24.39 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  25.13 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  27.97 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  22.44 
 
 		 462 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  26.85 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  26.85 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  24.91 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2730  TatD family hydrolase  27.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.53 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  31.58 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  28.08 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  25.5 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  27.97 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  27.97 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  24.14 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  28.67 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  26.57 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  27.97 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  26.57 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  27.45 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  26.57 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  24.85 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  31.58 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  24.66 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  20.69 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  27.15 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  27.15 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  27.15 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  28.48 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  27.15 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  26.76 
 
 		 265 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  32.88 
 
 		 262 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  25 
 
 		 268 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  21.99 
 
 		 263 aa  42  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  24.64 
 
 		 255 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  27.97 
 
 		 260 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>