19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1396 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 242 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  55.35 
 
 		 764 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  35.34 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2813  hypothetical protein  22.88 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00156648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  26.37 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 643 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 596 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 974 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  30.84 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  26.9 
 
 		 413 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 264 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  35.94 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>