More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2155 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  234  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  234  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.12 
 
 
195 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
196 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
197 aa  207  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0188  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.08 
 
 
206 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
195 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
196 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
194 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
196 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
196 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
197 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
197 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
196 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  201  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.81 
 
 
198 aa  201  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.81 
 
 
194 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51 
 
 
196 aa  197  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1474  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
196 aa  197  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.454661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
197 aa  197  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
197 aa  197  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0863  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  197  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.733546  normal  0.368952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
197 aa  195  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
197 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
198 aa  194  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  194  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
197 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
200 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
197 aa  193  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2124  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.83 
 
 
195 aa  193  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.263885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
197 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
213 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0314  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
197 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
199 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
199 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
199 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
197 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
197 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2443  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.56 
 
 
224 aa  191  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447729  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
195 aa  191  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
202 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
204 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
198 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
203 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
197 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>