More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0718 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  81.97 
 
 		 122 aa  201  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  197  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  196  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  76.42 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  182  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0338  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 160 aa  180  5.0000000000000004e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.47925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>