More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0403 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
123 aa  247  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  99.19 
 
 
123 aa  246  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3626  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00182904  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3812  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000039471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3699  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000119434  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3991  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000125728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  98.37 
 
 
123 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  97.56 
 
 
123 aa  244  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000092381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3904  50S ribosomal protein L14  97.56 
 
 
123 aa  243  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000392566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  97.56 
 
 
123 aa  243  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194944  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0293  50S ribosomal protein L14  97.56 
 
 
123 aa  243  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3741  50S ribosomal protein L14  96.75 
 
 
123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000040815  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4534  50S ribosomal protein L14  95.93 
 
 
123 aa  241  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143523  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  92.68 
 
 
123 aa  237  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000146326  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0338  50S ribosomal protein L14  90.24 
 
 
160 aa  227  5e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.47925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  90.24 
 
 
123 aa  226  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000108066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001732  LSU ribosomal protein L14p (L23e)  86.18 
 
 
123 aa  221  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000162129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00740  50S ribosomal protein L14  86.18 
 
 
123 aa  221  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  86.99 
 
 
123 aa  218  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0330  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
123 aa  217  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000213819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  87.8 
 
 
122 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  85.37 
 
 
122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  85.37 
 
 
122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  84.55 
 
 
122 aa  213  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  86.18 
 
 
122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  83.74 
 
 
122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  83.74 
 
 
122 aa  209  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06350  50S ribosomal protein L14  87.18 
 
 
116 aa  207  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  82.11 
 
 
122 aa  206  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  83.74 
 
 
122 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000123635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000182968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278183  unclonable  0.0000000000139083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000238487  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  82.93 
 
 
122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  203  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  203  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  82.11 
 
 
122 aa  202  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  202  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  82.11 
 
 
122 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  201  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  201  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  82.11 
 
 
122 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000141408  unclonable  0.0000000000497407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  201  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  201  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 
122 aa  200  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  200  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  200  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000168914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  200  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000280121  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  199  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  199  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  199  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  199  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  79.67 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  81.3 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000251869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  78.86 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  81.51 
 
 
119 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  78.05 
 
 
122 aa  194  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0999  ribosomal protein L14  82.11 
 
 
121 aa  194  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00274918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  80.49 
 
 
122 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 
122 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 
122 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  75.61 
 
 
122 aa  193  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  193  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  77.24 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000028271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  192  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 
122 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  77.24 
 
 
122 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
122 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>