23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1110 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  33.11 
 
 
331 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  32.42 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4610  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1897  hypothetical protein  32.56 
 
 
368 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  30.49 
 
 
382 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.04 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  30.08 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  24.73 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  28.73 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  23.5 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1138  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.61 
 
 
301 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.31 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.49 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  28.65 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  22.27 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  23.03 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.82 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.94 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2801  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5728  hypothetical protein  24.9 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.95 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  22.58 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>