13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5487 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5487  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  34.6 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1827  hypothetical protein  56.52 
 
 		 230 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226709  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  23.55 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2075  putative phage repressor  38.46 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3873  hypothetical protein  39.71 
 
 		 125 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.647087  normal  0.150356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  34.09 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  33.91 
 
 		 238 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>