More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4683 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2952  glycosyl transferase family 2  68.55 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  46.71 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.42 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.75 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.75 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.75 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  44.26 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  43.75 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  42.05 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  40.26 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  39.94 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.36 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  40.59 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  40.07 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  40.2 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  39.2 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  40.46 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  40.46 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  40.8 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  38.85 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  40.82 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.91 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  36.84 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  40.2 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  37.94 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  39.41 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.41 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  40.58 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  39.87 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  39.22 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 339 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  39.74 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  36.51 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  37.79 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  37.79 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  36.27 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  36.93 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  37.46 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 340 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  38.44 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  37.99 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.46 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  37.05 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  36.84 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  36.84 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  35.08 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 360 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  39.03 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  35.97 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>