19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3851 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  53.12 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  44.17 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  36.29 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  33.09 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  32.35 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  37.5 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  35.79 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  35.29 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  32.14 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  32.93 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  44.44 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  35.14 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  31 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  30.49 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>