21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3815 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.07 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  43.96 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  37.56 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  40.19 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  37.44 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  36.79 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  35.42 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.98 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  24.07 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  26.26 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  26.21 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.08 
 
 		 1077 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 689 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  27.68 
 
 		 341 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6312  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 380 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.874515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  29.52 
 
 		 339 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>