15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3344 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  58.95 
 
 		 650 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  45.05 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  40.97 
 
 		 323 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  50.93 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1168 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  30.99 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  37.78 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  27.64 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  33.72 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  32 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1037 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1074  hypothetical protein  36.11 
 
 		 284 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  29.2 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  23.45 
 
 		 562 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>