51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2196 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
292 aa  604  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  50.34 
 
 
313 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  41.44 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  39.27 
 
 
284 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  39.49 
 
 
284 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  36.59 
 
 
324 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  39.49 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  38.89 
 
 
307 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  36.88 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  36.52 
 
 
320 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  36.5 
 
 
309 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  31.88 
 
 
317 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  32.62 
 
 
270 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  30.91 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  30.74 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  33.46 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  32.84 
 
 
261 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  31.67 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  42.36 
 
 
207 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  29.82 
 
 
272 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  35.47 
 
 
278 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  29.27 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  27.78 
 
 
274 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  33.93 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  34.64 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
198 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  29.92 
 
 
262 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  27.34 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  32.32 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  42.11 
 
 
201 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  34.59 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  34.9 
 
 
180 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  34.27 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  36.88 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  27.76 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  30.82 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  30.92 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  31.45 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  32.88 
 
 
188 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  26.37 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  27.92 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  28.93 
 
 
217 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  34.65 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  26.16 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  39.29 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  37.65 
 
 
220 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  34.12 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  32.1 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  36.36 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  45.24 
 
 
215 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>