39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2554 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  457  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  83.96 
 
 
220 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  56.93 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  52.74 
 
 
209 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  49.25 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  47.57 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  36.84 
 
 
188 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  38.15 
 
 
180 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  36.05 
 
 
181 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  32.64 
 
 
217 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  37.57 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  32.04 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  31.75 
 
 
216 aa  89  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  35.16 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  32.57 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  33.86 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  32.92 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  31.17 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  38.3 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  31.11 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  32.57 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  32.68 
 
 
285 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  31.58 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  30.26 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  31.87 
 
 
317 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  32.24 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  30.25 
 
 
320 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  29.63 
 
 
320 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  36.14 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  30 
 
 
271 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  37.35 
 
 
313 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  34.12 
 
 
292 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  29.71 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  29.22 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  36.94 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  35.48 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  35.37 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  34.57 
 
 
300 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  29.49 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>