48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2981 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  54.37 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  46.79 
 
 
275 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  47.89 
 
 
272 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  51.21 
 
 
278 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  40.75 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  41.25 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  40.47 
 
 
284 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  41.31 
 
 
285 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  43.48 
 
 
262 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  35.36 
 
 
274 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  36.9 
 
 
320 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  33.81 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  36.16 
 
 
320 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  36.59 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  35.36 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  35.38 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  35.98 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  33.81 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  30.35 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  44.83 
 
 
198 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  32.95 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  36.43 
 
 
273 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  33.7 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  32.84 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  35.42 
 
 
317 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  32.96 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  31.88 
 
 
313 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  33.96 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  32.71 
 
 
267 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  33.2 
 
 
277 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  34.29 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  36.05 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  38.73 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  32.88 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  37.58 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  32.17 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  37.24 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  34.04 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  36.36 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  30.46 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  28.67 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  25.33 
 
 
197 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  32.08 
 
 
209 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  26.06 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  29.56 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>