52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00409 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  100 
 
 
324 aa  658    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  58.54 
 
 
320 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  57.91 
 
 
320 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  60.14 
 
 
309 aa  362  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  42.59 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  44.19 
 
 
300 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  36.65 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  37.32 
 
 
307 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  37.5 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  37.13 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  36.36 
 
 
317 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  36.26 
 
 
270 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  35.56 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  33.81 
 
 
261 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  31.94 
 
 
272 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  28.89 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  33.22 
 
 
277 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  32.6 
 
 
275 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  33.46 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  35.16 
 
 
198 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  35.71 
 
 
267 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  31.5 
 
 
262 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  35.14 
 
 
207 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  31.92 
 
 
278 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  28.73 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  33.13 
 
 
180 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  29.6 
 
 
296 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  33.66 
 
 
214 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  31.3 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  34.69 
 
 
216 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  34.48 
 
 
217 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  32.89 
 
 
217 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  35.62 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  30.52 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  36.6 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  36.73 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  34.78 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  30.14 
 
 
199 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  29.79 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  32.57 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  30.54 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  38.73 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  28.78 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  30.51 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  30.06 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  31.14 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  26.76 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  30.17 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  46.51 
 
 
214 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>